Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn22Q9D7U6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn22Q9D7U6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn22Q9D7U6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn22Q9D7U6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn22Q9D7U6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn22Q9D7U6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms