Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lingo1Q9D1T0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lingo1Q9D1T0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo1Q9D1T0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lingo1Q9D1T0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo1Q9D1T0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lingo1Q9D1T0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms