Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd12Q9CWU0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd12Q9CWU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd12Q9CWU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd12Q9CWU0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tdrd12Q9CWU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.6 ms