Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS1

Mmadhc, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MmadhcQ99LS1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MmadhcQ99LS1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MmadhcQ99LS1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MmadhcQ99LS1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MmadhcQ99LS1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms