Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CcsapQ8QZT2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CcsapQ8QZT2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcsapQ8QZT2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcsapQ8QZT2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CcsapQ8QZT2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcsapQ8QZT2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcsapQ8QZT2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcsapQ8QZT2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcsapQ8QZT2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcsapQ8QZT2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcsapQ8QZT2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms