Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsper4Q8BVN3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Catsper4Q8BVN3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Catsper4Q8BVN3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Catsper4Q8BVN3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms