Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SugctQ7TNE1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SugctQ7TNE1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SugctQ7TNE1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SugctQ7TNE1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SugctQ7TNE1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms