Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C4

Secisbp2, MCG1271, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2Q3U1C4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Secisbp2Q3U1C4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Secisbp2Q3U1C4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2Q3U1C4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2Q3U1C4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Secisbp2Q3U1C4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Secisbp2Q3U1C4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.7 ms