Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnnm3Q32NY4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm3Q32NY4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm3Q32NY4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnnm3Q32NY4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnnm3Q32NY4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnnm3Q32NY4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnnm3Q32NY4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnnm3Q32NY4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnnm3Q32NY4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm3Q32NY4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm3Q32NY4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnnm3Q32NY4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm3Q32NY4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm3Q32NY4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnnm3Q32NY4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cnnm3Q32NY4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnnm3Q32NY4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm3Q32NY4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cnnm3Q32NY4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnnm3Q32NY4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnnm3Q32NY4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnnm3Q32NY4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnnm3Q32NY4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnnm3Q32NY4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnnm3Q32NY4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms