Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf6P70196 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf6P70196 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf6P70196 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf6P70196 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf6P70196 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf6P70196 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf6P70196 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf6P70196 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf6P70196 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf6P70196 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf6P70196 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf6P70196 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf6P70196 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf6P70196 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf6P70196 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf6P70196 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf6P70196 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf6P70196 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf6P70196 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf6P70196 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf6P70196 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf6P70196 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf6P70196 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf6P70196 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms