Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.956e-10■■■■■ 35.8
MATR3P43243 MAP3K13-206ENST00000438053 2882 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.966e-10■■■■■ 35.8
MATR3P43243 RYK-201ENST00000460933 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.62□□□□□ -1.031e-9■■■■■ 35.8
MATR3P43243 MAP3K13-204ENST00000428617 573 ntTSL 48.12□□□□□ -1.116e-10■■■■■ 35.8
MATR3P43243 NAP1L1-208ENST00000547529 892 ntTSL 54.06□□□□□ -1.766e-10■■■■■ 35.8
MATR3P43243 NAP1L1-220ENST00000551524 460 ntTSL 23.97□□□□□ -1.776e-10■■■■■ 35.8
MATR3P43243 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 53.83□□□□□ -1.86e-10■■■■■ 35.8
MATR3P43243 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 53.72□□□□□ -1.816e-10■■■■■ 35.8
MATR3P43243 OR2W6P-201ENST00000439689 939 ntBASIC9.97□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-210ENST00000419063 835 ntTSL 317.75■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-247ENST00000470685 1790 ntTSL 516.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-261ENST00000493709 715 ntTSL 314.92□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-250ENST00000478249 594 ntTSL 514.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-242ENST00000463104 567 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-232ENST00000450341 567 ntTSL 413.03□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-205ENST00000393523 842 ntTSL 413.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-202ENST00000319454 2011 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-216ENST00000429056 534 ntTSL 412.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-234ENST00000451958 594 ntTSL 412.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-237ENST00000456060 543 ntTSL 412.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-207ENST00000414724 590 ntTSL 510.76□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-224ENST00000439914 565 ntTSL 59.37□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-226ENST00000444781 611 ntTSL 59.24□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-208ENST00000415274 626 ntTSL 49.24□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-220ENST00000435480 487 ntTSL 49.24□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-218ENST00000431902 562 ntTSL 58.49□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-215ENST00000428330 525 ntTSL 47.75□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-225ENST00000444771 760 ntTSL 26.27□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-243ENST00000464819 540 ntTSL 46.17□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-223ENST00000439049 549 ntTSL 46.13□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-214ENST00000425679 629 ntTSL 26.13□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-211ENST00000420158 572 ntTSL 45.85□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-213ENST00000421639 572 ntTSL 35.85□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-233ENST00000451701 582 ntTSL 35.18□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-219ENST00000432655 582 ntTSL 34.24□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-239ENST00000457247 573 ntTSL 43.92□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-244ENST00000464975 563 ntTSL 43.76□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-240ENST00000457934 553 ntTSL 43.26□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-227ENST00000445115 575 ntTSL 43.23□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-217ENST00000430503 499 ntTSL 53.05□□□□□ -1.922e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 SORBS2-238ENST00000456596 574 ntTSL 42.39□□□□□ -2.032e-6■■■■■ 35.7
MATR3P43243 NCOR1-216ENST00000579573 549 ntTSL 511.62□□□□□ -0.557e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 NCOR1-203ENST00000395849 3419 ntTSL 29.27□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 NCOR1-214ENST00000470782 3987 ntTSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 NCOR1-212ENST00000464381 2474 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.097e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 NCOR1-219ENST00000580554 650 ntTSL 28.1□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.27e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.27e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 NCOR1-217ENST00000579606 551 ntTSL 42.85□□□□□ -1.957e-7■■■■■ 35.6
MATR3P43243 KIAA0319L-215ENST00000478463 1489 ntTSL 225.02■■□□□ 1.62e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-209ENST00000470388 872 ntTSL 519.83■□□□□ 0.772e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-216ENST00000482929 1524 ntTSL 219.21■□□□□ 0.672e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-219ENST00000492888 872 ntTSL 319■□□□□ 0.632e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.612e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-214ENST00000476329 570 ntTSL 418.34■□□□□ 0.532e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-208ENST00000469892 889 ntTSL 513.63□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-203ENST00000426982 3213 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-205ENST00000440579 2171 ntTSL 210.38□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 KIAA0319L-220ENST00000494948 766 ntTSL 410.31□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 35.5
MATR3P43243 ZNF26-203ENST00000537956 733 ntTSL 323.2■■□□□ 1.33e-7■■■■■ 35.5
MATR3P43243 ZNF26-206ENST00000545101 590 ntTSL 418.76■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 35.5
MATR3P43243 ZNF26-204ENST00000540238 639 ntTSL 316.67■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 35.5
MATR3P43243 ZNF26-205ENST00000544181 834 ntTSL 316.53■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 35.5
MATR3P43243 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 35.5
MATR3P43243 WARS-207ENST00000553524 707 ntTSL 321.93■■□□□ 1.15e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-218ENST00000554772 562 ntTSL 320.37■□□□□ 0.855e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-214ENST00000554331 831 ntTSL 218.64■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-236ENST00000556783 567 ntTSL 518.64■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-239ENST00000557239 471 ntTSL 418.6■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-243ENST00000557722 848 ntTSL 517.87■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-206ENST00000553413 568 ntTSL 517.87■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-222ENST00000555063 573 ntTSL 216.36■□□□□ 0.215e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-231ENST00000556579 565 ntTSL 214.47□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-215ENST00000554509 563 ntTSL 414.47□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-229ENST00000556435 528 ntTSL 214.06□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-210ENST00000553769 560 ntTSL 413.83□□□□□ -0.25e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-217ENST00000554605 560 ntTSL 313.83□□□□□ -0.25e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-208ENST00000553545 591 ntTSL 412.12□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-235ENST00000556698 640 ntTSL 411.34□□□□□ -0.595e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-228ENST00000556338 547 ntTSL 411.34□□□□□ -0.595e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-230ENST00000556504 847 ntTSL 511.34□□□□□ -0.595e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-241ENST00000557347 577 ntTSL 411.34□□□□□ -0.595e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-233ENST00000556660 584 ntTSL 411.34□□□□□ -0.595e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.665e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.695e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-211ENST00000553808 1060 ntTSL 29.77□□□□□ -0.855e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.885e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-219ENST00000554820 538 ntTSL 47.73□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 35.4
MATR3P43243 WARS-237ENST00000557094 582 ntTSL 27.3□□□□□ -1.245e-8■■■■■ 35.4
Retrieved 100 of 16,209 protein–RNA pairs in 51 ms