Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt19P19001 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt19P19001 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt19P19001 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt19P19001 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt19P19001 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt19P19001 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt19P19001 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt19P19001 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt19P19001 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt19P19001 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt19P19001 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt19P19001 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt19P19001 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt19P19001 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt19P19001 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt19P19001 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt19P19001 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt19P19001 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt19P19001 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt19P19001 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt19P19001 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt19P19001 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt19P19001 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt19P19001 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt19P19001 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt19P19001 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt19P19001 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt19P19001 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt19P19001 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt19P19001 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt19P19001 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt19P19001 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt19P19001 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt19P19001 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms