Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sub1P11031 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sub1P11031 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sub1P11031 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sub1P11031 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sub1P11031 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sub1P11031 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sub1P11031 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sub1P11031 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sub1P11031 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sub1P11031 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sub1P11031 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sub1P11031 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms