Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC4

Apela, Apelin receptor early endogenous ligand, mousemouse

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApelaP0DMC4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApelaP0DMC4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApelaP0DMC4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApelaP0DMC4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApelaP0DMC4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApelaP0DMC4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApelaP0DMC4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms