Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-K1P01901 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-K1P01901 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-K1P01901 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-K1P01901 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-K1P01901 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-K1P01901 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms