Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5849J3QPE5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5849J3QPE5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5849J3QPE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5849J3QPE5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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