Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FgaE9PV24 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgaE9PV24 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FgaE9PV24 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FgaE9PV24 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FgaE9PV24 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FgaE9PV24 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms