Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC048679D3YXE9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BC048679D3YXE9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
BC048679D3YXE9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BC048679D3YXE9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BC048679D3YXE9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BC048679D3YXE9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms