Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc27A2A6Q5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc27A2A6Q5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc27A2A6Q5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdc27A2A6Q5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc27A2A6Q5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc27A2A6Q5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms