Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Col5a3Q9JLI2 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms