Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Trim12aQ99PQ1 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Trim12aQ99PQ1 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trim12aQ99PQ1 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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