Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rab11fip3Q8CHD8 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms