Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms