Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxa13Q62424 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.8 ms