Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Gm28047Q3US59 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Gm28047Q3US59 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Gm28047Q3US59 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Gm28047Q3US59 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Gm28047Q3US59 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Gm28047Q3US59 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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