Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Znf48Q3US17 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Znf48Q3US17 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Znf48Q3US17 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Znf48Q3US17 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Znf48Q3US17 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Znf48Q3US17 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Znf48Q3US17 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Znf48Q3US17 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Znf48Q3US17 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Znf48Q3US17 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Znf48Q3US17 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Znf48Q3US17 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Znf48Q3US17 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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