Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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Rpusd2Q149F1 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
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Rpusd2Q149F1 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rpusd2Q149F1 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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