Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cntn3Q07409 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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