Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Sh3bp1P55194 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms