Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Rpl28P41105 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms