Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms