Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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