Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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