Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
H2-Q1O19441 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms