Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smim18J3QNP2 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms