Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms