Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms