Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ccdc47Q9D024 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms