Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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PtprtQ99M80 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PtprtQ99M80 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PtprtQ99M80 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PtprtQ99M80 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprtQ99M80 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms