Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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BcanQ61361 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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BcanQ61361 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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BcanQ61361 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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BcanQ61361 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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BcanQ61361 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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BcanQ61361 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BcanQ61361 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BcanQ61361 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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