Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BtrcQ3ULA2 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms