Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Siah1bQ06985 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Siah1bQ06985 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Siah1bQ06985 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Siah1bQ06985 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms