Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms