Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VdrP48281 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
VdrP48281 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
VdrP48281 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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VdrP48281 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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VdrP48281 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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