Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms