Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Hoxd10P28359 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Hoxd10P28359 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Hoxd10P28359 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd10P28359 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms