Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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