Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spta1P08032 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spta1P08032 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spta1P08032 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spta1P08032 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms