Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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Ccl20O89093 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccl20O89093 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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