Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Spocd1B1ASB6 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Spocd1B1ASB6 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Spocd1B1ASB6 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Spocd1B1ASB6 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Spocd1B1ASB6 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Spocd1B1ASB6 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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